Xử lý hóa đơn đầu vào bị bỏ sót từ ngày 01/07/2025 theo Luật Thuế GTGT mới

Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 ban hành ngày 26/11/2024 có hiệu lực từ ngày 01/7/2025 (trừ trường hợp tại khoản 2 Điều 18 có hiệu lực từ 01/01/2026).

Theo đó, điểm đ khoản 1 Điều 14 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 quy định như sau:
Khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào
1. Cơ sở kinh doanh nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp khấu trừ thuế được khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào như sau:
…
đ) Thuế giá trị gia tăng đầu vào phát sinh trong tháng, quý nào được kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế phải nộp của tháng, quý đó. Số thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết trong tháng, quý thì được khấu trừ vào tháng, quý tiếp theo.
Trường hợp cơ sở kinh doanh phát hiện số thuế giá trị gia tăng đầu vào khi kê khai, khấu trừ bị sai, sót thì được khai thuế trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế như sau:
Người nộp thuế thực hiện khai bổ sung vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót nếu việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót làm tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế được hoàn; người nộp thuế phải nộp đủ số tiền thuế phải nộp tăng thêm hoặc bị thu hồi số tiền thuế đã được hoàn tương ứng và nộp tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước (nếu có).
Người nộp thuế thực hiện khai vào tháng, quý phát hiện sai, sót nếu việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ chuyển sang tháng, quý sau;
Theo đó, việc kê khai hóa đơn đầu vào theo Luật mới từ 01/7/2025 sẽ thực hiện theo 2 trường hợp sau:
(1) Kê khai vào kỳ phát sinh tức kỳ bị sai, sót
Khi việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót làm tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế được hoàn
(2) Kê khai vào kỳ phát hiện
Khi khai thuế vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ chuyển sang tháng, quý sau.
Như vậy, khi cơ sở kinh doanh kê khai sót hóa đơn đầu vào thì phải kê khai tăng số thuế đầu vào đã kê khai thiếu đó lên dẫn đến việc làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc chỉ làm tăng số thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ chuyển sang kỳ sau.
Điều này cũng có nghĩa là từ ngày 01/07/2025, nếu như doanh nghiệp phát hiện kê khai sót hóa đơn đầu vào thì sẽ kê khai vào kỳ phát hiện.

Theo quy định tại điểm đ khoản 6 Điều 1 Luật số 31/2013/QH13 quy định về khấu trừ thuế GTGT đầu vào và

Theo quy định tại khoản 8 Điều 14 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn nguyên tắc khấu trừ thuế GTGT đầu vào thì:
Điều 14. Nguyên tắc khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào
…
8. Thuế GTGT đầu vào phát sinh trong kỳ nào được kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế phải nộp của kỳ đó, không phân biệt đã xuất dùng hay còn để
trong kho.

Trường hợp cơ sở kinh doanh phát hiện số thuế GTGT đầu vào khi kê khai, khấu trừ bị sai sót thì được kê khai, khấu trừ bổ sung trước khi cơ quan thuế,
cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế tại trụ sở người nộp thuế.
Vậy là:
Đối với Hóa đơn GTGT đầu vào các kỳ trước bị sót chưa kê khai thì doanh nghiệp được kê khai bổ sung vào kỳ kê khai (tháng, quý) phát sinh
hóa đơn.